زیست شناسی مولکولی کاربردی

زیست شناسی مولکولی کاربردی

بررسی بیوانفورماتیکی اثر ترکیبات تئوفیلین، مالیک اسید، ویتامین ث و زایلیتول در مهار آنزیم گلوکان سوکراز به منظور درمان بیماری پوسیدگی دندان

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسنده
چکیده
زمینه و هدف: پوسیدگی دندان از رایج‌ترین مشکلات دهان و دندان است که باکتری استرپتوکوک موتانس نقش مهمی در ایجاد آن دارد. این باکتری در حضور قند باعث تولید نوعی اسید می‌شود که به مینای دندان آسیب می‌رساند. این مطالعه قصد دارد با هدف بررسی بیوانفورماتیکی اثر ترکیبات تئوفیلین، مالیک اسید، ویتامین ث و زایلیتول در مهار آنزیم گلوکان سوکراز (گلوکوزیل تراسفراز) که باعث ایجاد بیوفیلم‌های باکتری استرپتوکوکوس موتانس می‌شود در جهت معرفی ترکیبات مؤثر در درمان بیماری پوسیدگی دندان گامی بردارد.
روش‌ها: در این مطالعه برای بررسی نحوۀ اتصال ترکیبات به جایگاه فعال آنزیم، ترسیم ساختار شیمیایی ترکیبات، تبدیل فایل‌ها با فرمت Pdb حاصل از ترسیم Ligandها به فرمت SSD، بررسی بروز سمیت احتمالی ترکیبات شیمیایی، بهینه‌سازی انرژی، مطالعات داکینگ و تجزیه و تحلیل‌های نهایی به ترتیب از سرور آنلاین H Dock، نرم‌افزار  Hyperchem،Open Babel، سرور آنلاین adverpred، نرم‌افزارهای Chimera و Discovery استفاده شد.
یافته‌ها: ترکیبات مورد مطالعه قادر به اشغال جایگاه فعال آنزیم‌اند و می‌توانند نقش مهاری داشته باشند.
نتیجه‌گیری: ویتامن ث و تئوفیلین با بروز سمیت احتمالی کمتر و برقراری تعداد پیوند هیدروژنی بیشتر ترکیبات بهتری برای مهار آنزیم گلوکان سوکراز به حساب می‌آیند.
کلیدواژه‌ها