سلول‌های بنیادی سرطان (CSC) زیرمجموعه‌ای از سلول‌های سرطانی هستند که معمولاً به درمان‌های رایج مقاوم هستند و به‌عنوان سلول‌های شروع‌کننده تومور شناخته می‌شوند. درواقع منشأ ناهمگون بودن یا هتروژنیتی تومورها همین سلول‌های بنیادی سرطان هستند. سایر فعالیت‌های بیولوژیکی سلول‌های بنیادی سرطان خود نوسازی، بازگشت بیماری بعد از درمان اولیه و متاستاز می‌باشد. سلول‌های بنیادی سرطان از تومورها و رده‌های سلولی مختلف جداسازی و تعیین خصوصیت شده‌اند. در این مقاله، مفهوم کلی، خصوصیات CSCها و روش‌های جداسازی این سلول‌ها به اختصار مورد بحث قرار می‌گیرد. به‌این‌ترتیب، با افزایش دانش به دست آمده از مطالعات مربوط به بیولوژی CSCها بعد از جداسازی آن‌ها، می‌توان رویکردهای جدیدی را برای درمان هدفمند سرطان‌ها ارائه کرد.