زیست شناسی مولکولی کاربردی

زیست شناسی مولکولی کاربردی

ارزیابی بیوانفورماتیکی پپتیدهای سیکلوتید‌ی گیاهی جهت شناسایی کارآمدترین پپتید برای تولید داروی نوترکیب

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان
1 گروه زیست فناوری، دانشکده زیست فناوری، دانشگاه تخصصی فناوری‌های نوین
2 گروه زیست فناوری میکروبی، دانشکده زیست فناوری، دانشگاه تخصصی فناوری‌های نوین
چکیده
مقدمه: سرطان یکی از بیماری‌های تهدیدکننده حیات در سراسر جهان است. روش‌های درمانی مرسوم سرطان شامل شیمی‌درمانی و پرتودرمانی است که هر دو با عوارض جانبی جدی همراه هستند. پپتیدهای حلقوی گیاهی به‌عنوان عوامل ضدسرطانی قوی با فعالیت زیستی بالا و پایداری ساختاری مناسب مطرح شده‌اند.
روش‌ها: در این مطالعه، تحلیل‌های بیوانفورماتیکی برای بررسی ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی، ساختاری و تکاملی پپتیدهای حلقوی گیاهی انجام شد. داده‌ها از پایگاه NCBI استخراج و با ابزارهای بیوانفورماتیکی ProtParam،Psipred  وMega6 تحلیل شدند.
نتایج: تحلیل‌ها نشان داد که سیکلوتیدهای مورد مطالعه از نظر ساختاری بسیار پایدار بوده و شاخص ناپایداری آنها کمتر از 40 است. تحلیل‌های فیلوژنتیکی نشان داد که سیکلوتید شناسایی‌شده از گونه Clitoria ternatea به‌دلیل فعالیت زیستی مطلوب، احتمالاً بهترین گزینه برای استفاده است.
نتیجه‌گیری: به‌دلیل پایداری و سایر ویژگی‌های منحصربه‌فرد، سیکلوتیدها کاندیدای بسیار قوی برای توسعه داروهای ضدسرطانی هستند. توالی AEK26412.1 به‌عنوان گزینه‌ای مناسب برای تولید پپتید نوترکیب در مهندسی ژنتیک، به‌دلیل ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی و ساختاری مطلوب پیشنهاد می‌شود.
کلیدواژه‌ها